La partie biologie de synthèse permettra aux étudiants d’approcher une nouvelle discipline sous ses différents aspects (scientifiques, techniques, éthiques, théoriques et pratiques…).
Concernant la partie bio-informatique les élèves seront amenés à appliquer des concepts fondamentaux de biologie, mathématique et informatique pour l’étude du génome et la modélisation des données génomiques.
| A la fin de l’unité pédagogique, l’élève sera capable de : | Niveau de taxonomie | Priorité |
|---|---|---|
| Acquérir des connaissances sur cette nouvelle science qu’est la biologie de synthèse. | 2. Comprendre | Important |
| Analyser des applications de la biologie de synthèse. | 4. Analyser | Utile |
| Appliquer des concepts fondamentaux de biologie, mathématique et informatique pour l’étude du génome. | 3. Appliquer | Important |
| Appliquer différents méthodes de modélisation selon le type de données mises à disposition. | 3. Appliquer | Utile |
| Formuler un enchainement cohérent justifiant l'application des différents méthodes de modélisation pour résoudre un problème proposé. | 5. Synthétiser | Important |
| Part de l'évaluation individuelle | Part de l'évaluation collective | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Examen sur table : | % | Livrable(s) de projet : | % | ||
| Examen oral individuel : | % | Exposé collectif : | 50 | % | |
| Exposé individuel : | % | Exercice pratique collectif : | % | ||
| Exercice pratique individuel : | 25 | % | Rapport collectif : | 25 | % |
| Rapport individuel : | % | ||||
| Autre(s) : % | |||||
| Type d’activité pédagogique : | Contenu, séquencement et organisation |
|---|---|
| Cours | Afin d’acquérir des connaissances sur cette nouvelle science qu’est la biologie de synthèse, des cours présenteront les concepts, définitions, historique et principes. L’étudiant aura également l’opportunité d’appréhender les différentes approches, outils et moyens techniques. Des considérations éthiques seront également abordées. Enfin, les étudiants verront les réalisations actuelles et futures dans différents domaines. |
| Travaux Dirigés | Afin d’être capable d’analyser des applications de la biologie de synthèse, les étudiants aborderont le concours iGEM (origine, principe…). Des exemples seront détaillés et une méthodologie d’analyse sera proposée. Cette activité sera l’occasion pour les étudiants d’apprendre à analyser, commenter et présenter un projet de biologie de synthèse. |
| Cours | Les étudiants suivront une introduction à la bioinformatique qui vise à donner l’ensemble des bases nécessaires pour aborder les problématiques phares en bioinformatique. En particulier, les étudiants verront les points suivants : - Introduction et rappels en génomique - Banques de données - Alignement de séquences - Méthodes de modélisation de données génomiques - Application des méthodes pour la médicine personnalisée dans le traitement du cancer |
| Travaux Dirigés | Les étudiants auront ensuite des travaux pratiques en bioinformatique, représentant une mise en application directe du cours et permettant aux élèves d’utiliser des logiciels les plus importants : - Alignement de séquences - Modélisation des données génomiques |