Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- recherche:cluster:softwares [05/04/2023 00:10] – julien.favre
+++ recherche:cluster:softwares [05/04/2023 16:42] (Version actuelle) – julien.favre
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 ==== Utiliser MTEX sur le cluster ====
+Référent: `[[julien.favre@emse.fr]]`
 Mtex est un package utilisable avec Matlab pour traiter les cartes EBSD. La documentation est disponible sur : https://mtex-toolbox.github.io/
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 </Code>
 Pensez bien à modifier la version importée de matlab en mettant la commande module load matlab/R2020b
-Pour lancer un job matlab il faut bien utiliser la commande "matlab -nodisplay -nojvm -nodesktop -nosplash -r run_mtex" avec "run_mtex" le nom de votre fichier de script, vérifiez que c'est bien cette commande que vous avez dans le fichier job.
+Pour lancer un job matlab il faut bien utiliser la commande "matlab -nodisplay -nojvm -nodesktop -nosplash -r run_mtex" avec "run_mtex" le nom de votre fichier de script (sans marquer l'extension ".m"), vérifiez que c'est bien cette commande que vous avez dans le fichier job. Gardez le nom de script "run_mtex", car on va l'utiliser juste après...
 Une fois que vous avez fait ça, dans votre script il faut d'abord lancer Mtex, puis après seulement lancer votre script de post-traitement. Je vous propose donc de faire un script matlab de lancement; faites un fichier "run_mtex.m" contenant :
 <Code:bash>
-cd /export/home/tartempion/mtex-5.9.0
+cd ~/mtex-5.9.0
 startup_mtex
-cd /export/tartempion/mtex
+cd ~/mtex
 monscriptmtexici
 </Code>
-avec "tartempion" à remplacer par votre nom d'utilisateur, et "monscriptmtexici" à remplacer par votre nom de fichier de script Mtex.
+avec "monscriptmtexici" à remplacer par votre nom de fichier de script Mtex (sans marquer l'extension ".m"). On suppose aussi ici que votre répertoire de travail est /export/home/tartempion/mtex. Donc pensez bien à ajuster ce nom de répertoire dans le script de lancement.
-Donc quand vous lancez un traitement depuis un dossier de travail, mettez le fichier job dedans, qui lance run_mtex.m, qui lance mtex et lance votre script. A priori ça devrait marcher. Sinon, n'hésitez pas à compléter ce tuto...
+Pour résumer, quand vous lancez un traitement depuis un dossier de travail, mettez le fichier job dedans, celui-ci va lancer run_mtex.m, qui démarre Mtex et lance votre script. A priori ça devrait marcher. Sinon, n'hésitez pas à compléter ce tuto...